聚合物水泥防水涂料和JS防水涂料是两种常用的防水材料。它们在防水功能、施工方法、耐久性等方面存在一些区别。

首先，聚合物水泥防水涂料是由聚合物水泥、高分子聚合物和防水助剂等所构成的一种防水涂料。它具有良好的弹性和抗冻性能，能够适应不同温度和湿度环境下的变化。同时，聚合物水泥防水涂料还具有良好的附着力和耐候性，能够长时间保持防水效果。在施工方面，聚合物水泥防水涂料通常需要先进行底层处理，然后再涂刷多层涂料，一般需要较长的施工周期。

相比之下，JS防水涂料是一种新型的化学合成材料，具有良好的抗渗透能力和耐化学腐蚀性能。它能够有效防止水分的渗透和侵蚀，具有优异的防水效果。另外，JS防水涂料施工方便快捷，只需要刷涂一层即可形成防水层，大大缩短了工期。

此外，聚合物水泥防水涂料和JS防水涂料在耐久性方面也存在一些差异。聚合物水泥防水涂料由于有较多的施工层次，涂层之间的接触面积较大，所以在使用一段时间后可能会产生一些开裂、脱落等问题，导致防水效果的下降。而JS防水涂料因为施工简单，涂层之间的接触面积较小，所以在使用过程中能够保持较长时间的防水效果。

综上所述，聚合物水泥防水涂料和JS防水涂料在防水功能、施工方法、耐久性等方面存在一定的区别。选择合适的防水涂料应根据具体的使用需求和施工条件来决定。